尊龙凯时近日在《Cancercell》发表了一项关于癌症相关成纤维细胞（CAFs）的大规模空间转录组研究，具有重要临床意义。该研究涉及八种癌症类型的详细分析，所使用的技术和数据集极为丰富，涵盖了多种空间组学平台。

研究背景

癌症相关成纤维细胞（CAFs）是影响肿瘤微环境（TME）和治疗反应的重要细胞群体。尽管CAFs被视作潜在的治疗靶点，但研究发现某些干预措施竟可能加速肿瘤的进展。尽管单细胞RNA测序（scRNA-seq）为CAFs的研究提供了新的视角，但目前仍缺乏空间背景的信息，限制了对CAFs表型与功能的深入理解。本研究旨在通过多种空间组学技术来填补这一空白。

研究思路

本研究采用了多项高端技术，包括CosMx、MERSCOPE、Visium等，对非小细胞肺癌（NSCLC）、乳腺癌、结肠癌、前列腺癌、子宫癌、卵巢癌、肝癌和黑色素瘤等八种癌症中的CAFs进行了全面的空间转录组分析。通过分析570多个万细胞的数据，研究者识别出了四种具有独特空间组织方式的CAF亚型：s1-CAFs、s2-CAFs、s3-CAFs和s4-CAFs。

研究结果

在CosMx数据集中，研究者分析了不同CAFs微环境中主要免疫细胞类型的状态，包括T细胞、巨噬细胞、B细胞和浆细胞，充分展示了s1至s4 CAFs的空间异质性。进一步整合MERSCOPE数据后，发现CAFs亚群在不同癌种间具有保守性。其中，s2-CAFs是最普遍的亚型，存在于所有研究的组织切片中；s4-CAFs和s1-CAFs紧随其后，s3-CAFs则主要出现在肺癌、肝癌和结肠癌样本中。

为探讨不同CAFs亚型对肿瘤微环境的影响，研究者将切片划分为肿瘤床、肿瘤边缘和肿瘤远端三个区域，分析了每个区域内CAFs亚型与T细胞比例的相关性。此外，采用Xenium5K数据集对卵巢癌、宫颈癌等样本的空间组织模式进行了验证，发现某些CAFs亚型高表达与免疫逃逸相关的基因，揭示了CAFs与肿瘤细胞之间复杂的相互作用。

研究者还应用COMET技术进一步证实了CAFs的空间组织异质性，结合CODEX和IMC数据集探讨CAFs亚型的临床相关性，结果表明，s1-CAFs与较短的生存期呈正相关，而较高比例的s4-CAFs则与较长的生存期显著相关。

研究意义

此次研究运用CosMx和MERSCOPE平台对癌症相关成纤维细胞（CAFs）进行了深入的空间转录组分析，并通过多个独立的数据集验证了亚型的保守性和临床相关性。这一研究为理解CAFs的空间异质性及其在肿瘤进展和免疫调节中的作用提供了新的视角，为未来癌症研究与治疗策略的制定奠定了重要依据。

总的来说，尊龙凯时认为，本研究不仅为深入理解癌症相关成纤维细胞的空间特征提供了宝贵的资源，也为后续在癌症治疗中开发针对CAFs的新型疗法提供了理论基础和实践方向。